1年9班消失不见，朝比奈学姐视其形同路人，甚至早已死去的朝仓也代替凉宫春日坐在了阿虚的后面，而春日则如同人间蒸发一般无人知晓。当他冲向SOS团的教室时，只看到了孤零零坐在角落里看书的长门有希，一向淡定自若、冷如冰霜的长门大神也变成了怯懦害羞的乖乖女。从前一日长门留下的蛛丝马迹中，阿虚判断出这个世界似乎被某人重组了一番。 此时的阿虚，握有连接两个绝然不同世界的钥匙，他面临着重大的选择……
吸血鬼女王菲尔曾经热爱人类，从战场上消失了。在战火蔓延的都市中，两人实现了命运般的相遇。很久以前，有一个吸血鬼和人类共同生活的乐园。这是一个为了寻求乐园而旅行的少女和吸血鬼的故事。
